在堆肥過程中，隨著物料中微生物活動的加劇，微生物分解有機物所釋放出的熱量大于堆肥的熱耗時，堆肥溫度就上升。因此溫度是判斷微生物活動劇烈程度的最好參數。

畜禽糞便堆肥發酵設備

溫度的作用主要是影響微生物的生長，一般認為高溫菌對有機物的降解效率高于中溫菌，當今的快速、高溫好氧堆肥正利用這一特點，在堆肥的初期，堆體溫度一般與環境溫度相近，經過中溫菌1~2d的作用，堆肥溫度便能達到高溫菌的理想溫度50~65℃，按此溫度，一般堆肥5~6d,即可完成無害化過程。因此，在堆肥過程中，堆體溫度應控制在50~65℃之間，但在55~65℃時比較好，不易超過60℃。溫度超過60℃，微生物的生長活動即開始受到抑制。溫度過高會過度消耗有機質，并降低堆肥產品質量。為達到殺滅病原菌的效果，對于裝置式系統（反應器系統）和靜態通風垛系統，堆體內部溫度大于55℃的時間必須3d。對于條垛式系統，堆體內部溫度大于55℃的時間至少為15d,且在操作過程中至少達3d。對于條垛式系統，堆體內部溫度大于55℃的時間至少為15d,且在操作過程中至少翻堆5次。

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根據繪制的常規堆肥溫度變化曲線，可判斷發酵過程的進展情況。如測出溫度偏離常規溫度曲線，就表明微生物的活動受到了某種因素的干擾或阻礙，而常規的影響因素主要是供氧情況和垃圾含水量。一般地，在堆肥初期的3~5d中，通風的主要目的是滿足供氧，使生化反應順利進行，已達到提高堆體溫度的目的。當堆肥溫度升到80~90℃，這將嚴重影響微生物的生長繁殖，因此必須通過加大通風量將堆體內的水分和熱量帶走，使堆溫下降。

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在生產實際中，往往通過溫度-供氣反饋系統來完成溫度的自動控制，通過在堆體中安裝溫度反饋系統，當堆體內部溫度超過60℃時，風機自動開始向堆體內送風，從而排出堆料中的熱量和水汽，使堆體溫度降下來。而對于無通氣系統的條垛式堆肥，則采用定期翻堆來實現通風控溫。若運行正常，而堆溫卻持續下降，即可判定堆肥已進入結束前的降溫階段。